2.デフスミスとの物議を醸す関係: ヒューストンが戦闘後にサンタ・アナと交渉する特使としてデフ・スミスを任命したことは眉をひそめた。スミスは信頼できない人物とみなされ、ヒューストンの判決に対する批判につながり、政治的分裂を引き起こした。
3.政治的内紛: ヒューストンは敵対者からの絶え間ない政治的挑戦に直面した。彼の政策や決定は政敵や派閥との衝突を頻繁に引き起こし、激しい政治的内紛や彼の指導力への挑戦につながった。
4.ネイティブアメリカン部族との紛争: テキサス共和国大統領としての第一期および第二期におけるヒューストンとアメリカ先住民の部族との交流はしばしば緊張したものであった。一部の部族は中央集権的な政府を確立しようとする彼の努力に抵抗し、緊張と紛争を引き起こした。
5.経済的不始末: ヒューストン政権は、しばしば彼の型破りな財政政策が原因で、重大な財政的課題に直面した。彼の反対派は彼の経済的失政、特に国家財政の取り扱いと価値の下落した財務省紙幣の発行を批判した。
6.アフリカ系アメリカ人をめぐる論争: アフリカ系アメリカ人に対するヒューストンの立場は複雑だった。彼は奴隷を解放し、テキサス州への奴隷制度の拡大に反対したが、解放された奴隷のアフリカやメキシコへの移住も主張した。この姿勢は奴隷制度廃止論者と奴隷制拡大支持者の両方から批判を招いた。
7.弾劾の試み: 1842年、ヒューストンは下院による弾劾の試みに直面した。彼は、無許可の軍事行動、職権乱用、憲法規定違反など、さまざまな罪で告発された。弾劾動議は最終的に否決されたが、同氏が政府内から直面した反対を浮き彫りにした。
8.併合と拡張: ヒューストンは米国によるテキサス併合において重要な役割を果たした。しかし、彼はまた、米墨戦争や奴隷制度の拡大など、併合の潜在的な影響についても懸念を抱いていた。併合プロセスに対する彼の留保は、政治的同盟者との意見の相違を引き起こした。