第一に、ビンラディンは世界的なカリフ制の樹立を目指すイスラム教の過激派解釈に深く影響を受けていた。同氏は米国をこの目標への主な障害とみなし、世界貿易センターと国防総省への攻撃はイスラム世界における米国の影響力を弱めるために必要な措置だとみなした。
第二に、ビンラディンは中東問題への米国の関与、特にイスラエル支援とサウジアラビアにおける米軍駐留に対して強い政治的反対を抱いていた。同氏は、米国の行動はイスラムの価値観を軽視し、イスラムの主権を侵害していると信じていた。
さらに、ビンラディンには世界貿易センターを標的とした個人的な理由があった。 1990年代、米国はビンラディンのサウジアラビアでの建設事業に制裁を課し、ビンラディンに多大な経済的損失を与えた。さらに、メッカとメディナがあるサウジアラビアにおける米軍の駐留は、ビンラディンの宗教的信念に対する侮辱とみなされていた。
全体として、9/11の攻撃は、イデオロギー的過激主義、政治的反対、そしてビンラディンが米国とその中東政策に対して抱いていた個人的な不満が複雑に組み合わさったものによって引き起こされた。