セラは 1713 年にスペインのマヨルカ島ペトラで生まれました。 本名はミゲル・ホセ・セラ・ フェラテルでした。 。若い頃、彼はイエズス会に入ることを考えましたが、16歳のとき、パルマの修道院のフランシスコ会に入りました。彼は、13 世紀のイタリアの聖人ジュニペラスにちなんでジュニペロという宗教名をとりました。
セラは 1737 年に司祭に叙階され、その後 15 年間リュックマジョール大学で哲学を教えました。 1749年、彼は新世界での宣教奉仕に志願した。
セラは 1749 年初頭にアメリカ大陸に向けて出航し、最初にメキシコのベラクルスに到着し、その後メキシコシティに到着しました。彼は1758年にバハ・カリフォルニアに割り当てられるまで、メキシコのシエラゴルダ地方で8年間宣教師として働きました。
1767年、セラはスペイン当局によってフランシスコ会宣教師のグループを率いて、最近スペインがメキシコから買収したばかりのアルタ（アッパー）カリフォルニアへの宣教師に選ばれた。セラは 1769 年にカリフォルニアに 3 つの伝道所を設立しました。その中には、カリフォルニアにおける最初のヨーロッパ人定住地であるサンディエゴ デ アルカラ伝道所も含まれます。
セラはアルタ・カリフォルニアで合計9つのミッションを設立した。彼はこの地域を広く旅し、しばしば裸足で重い十字架を担いで歩き、ネイティブアメリカンの人々にキリスト教について説教しました。彼は何千人ものアメリカ先住民をカトリックに改宗させたと信じられています。
セラは宣教活動中に、アメリカ先住民との紛争や物資の不足など、数多くの課題に直面しました。晩年は体調不良にも悩まされた。それにもかかわらず、彼は 1784 年に亡くなるまで、カリフォルニアでキリスト教を広める努力を続けました。
セラの遺産は複雑で物議を醸している。彼は宣教への熱意と人道的努力を称賛する人もいるが、スペインによるカリフォルニア植民地化における役割やアメリカ先住民の扱いについても批判されている。
1987年、セラは教皇ヨハネ・パウロ2世によって聖人として列聖された。ローマ・カトリック教会の典礼暦では8月28日に記念される。