今日でも、多くの人は、それまでに蓄積されたすべての科学知識の発展には合理的思考が主な役割を果たしたと信じています。観察と実験は、人間が自然の大きな未知を解明するのに役立ちました。この意味で、人間の利益によって推進されるこれらすべての活動の主な受益者として自然科学（生物学、物理学、化学）が観察されるのが通例です。
しかし、科学の発展において宗教的信念や思想が完全に離れたわけではありません。この考えの明確な証拠は、神秘的な学者グループである錬金術師に注目するとわかります。これらの「科学者」たちの説明によれば、化学物質や有機物質の操作に対する彼らの関心は、永遠の命の秘薬の絶え間ない探求や金属の金への変換に関連していました。
14 世紀から 16 世紀に全盛期を迎えた錬金術の起源は古代エジプトにあります。アレクサンドリア皇帝によって設立された知識の中心地であるアレクサンドリアの都市では、キニアと呼ばれる古代エジプトの技術に関する文書が収集されました。このエジプトの技術には、防腐処理と金属の取り扱いの化学プロセスを習得することが含まれていました。キミアはギリシャの知恵に触れ、すべての物質は土、空気、水、火という 4 つの基本要素で構成されていると考えるようになりました。
ローマがエジプトを支配していた時代、錬金術は帝国当局によって非難されるようになりました。 330 年にコンスタンティヌス帝の命令によりキリスト教が公認されると、錬金術の実践に関与した異端者のグループがローマ当局によって迫害されました。ネストリウス派として知られるこれらの錬金術実践者は、ペルシャでの宗教的迫害から逃れてきました。当時、多くのペルシア人がこれらの技術を習得することに興味を持ちました。
イスラムの拡大は、錬金術の知識の保存と拡大においても非常に重要でした。イスラム教徒の聖典であるコーランは、自然を知ることがアッラーに近づく賞賛に値する方法であると予告していました。したがって、多くのアラブ人は化学元素と貴金属に関する研究を開発しました。この種の知識はイスラム世界で発展しましたが、中世ヨーロッパではこれらの研究についてほとんど知りませんでした。
中世後期の十字軍運動により、錬金術がヨーロッパ人に知られるようになりました。一部の錬金術師によって提案された彼の永遠の命の探求は、当時の宗教的思想と衝突しました。この種の大胆さは、神だけが永遠の命の賜物を授けることができるという考えに対する違反であるとみなされました。したがって、迫害の可能性を回避したり、自分の知識が暴露されることを避けるために、錬金術師は自分たちが開発したプロセスや実験を維持する複雑な象徴を使用していました。
教会からは眉をひそめられていたにもかかわらず、錬金術は一部の聖職者の間では一般的な活動でした。ロジャー・ベーコンと聖トーマス・アクィナスは、他の物質や機械人間の創造を通じて金を獲得することを報告したいくつかの実験を書きました。 16 世紀、錬金術は新たな理解を得始めました。英国の哲学者フランシス・ベーコン（1561 – 1626）は、錬金術が他の有望な種類の科学知識を発展させる可能性があるとすでに信じていました。
17 世紀に、ロバート ボイルは、新しい科学、化学の誕生を発見するいくつかの点を打ち出し始めました。どうやら彼のアイデアは錬金術の神秘的な側面から遠ざかろうとしたようです。しかし、ボイル自身は金属は変換できると信じていました。アイザック・ニュートン (1643-1727) も錬金術に興味を持った偉大な科学者でした。 「賢者の石」の発見は彼の研究のいくつかを占めました。
17 世紀を通じて、錬金術の暗号や秘密に直面して、科学的知識の普及がスペースを獲得しました。さらに、啓蒙思想によって擁護された信仰と理性の分離により、錬金術の知識は単なる発明とみなされるようになりました。
永遠の命と物質的な快適さを追求する信念に恵まれていたとしても、錬金術は科学の発展の歴史の外に位置づけることはできませんでした。化学プロセスや一部の元素の研究に使用される機器の多くは、錬金術師たちの起業家精神のおかげで作られました。さらに、化学元素の変換に関する理論は、20 世紀に開発されたいくつかの研究によって確認されました。