1860年、ブレッキンリッジは南部民主党の候補として大統領に立候補した。選挙ではエイブラハム・リンカーンに敗れたが、南部のほとんどの州の支持を得た。リンカーンの当選後、ブレッキンリッジは南部での脱退運動の指導に貢献した。彼は、連邦政府が南部諸州の権利を侵害したため、南部諸州には連邦から脱退する権利があると信じていた。
南部の脱退に関するブレッキンリッジの見解は当時物議を醸しており、現在でも議論が続いている。彼が米国に対する裏切り者だったと信じる人もいれば、南部の権利の擁護者だったと信じる人もいます。
南部分離に対するブレッキンリッジの見解は、ケンタッキー州での生い立ち、イェール大学での教育、政治的経験など、多くの要因によって形成された。彼は奴隷所有の家庭で育ち、幼い頃から奴隷制を支持する議論にさらされていました。彼はイェール大学に通い、そこで法律と政治学を学びました。イェール大学で北部奴隷制度廃止運動の思想に触れ、奴隷制度に対してますます批判的になった。しかし、彼は依然として南部諸州には連邦から脱退する権利があると信じていた。
イェール大学を卒業した後、ブレッキンリッジはケンタッキー州に戻り、政治家としてのキャリアを始めた。彼はケンタッキー州下院議員とケンタッキー州上院議員を務めた。彼は米国下院議員および米国上院議員でもありました。上院では、ブレッキンリッジは州の権利と奴隷制度を強力に支持していることで知られるようになった。彼は、奴隷制度の新たな領域への拡大に反対する共和党の綱領に反対した。
1860年、ブレッキンリッジは南部民主党の候補として大統領に立候補した。選挙ではエイブラハム・リンカーンに敗れたが、南部のほとんどの州の支持を得た。リンカーンの当選後、ブレッキンリッジは南部での脱退運動の指導に貢献した。彼は、連邦政府が南部諸州の権利を侵害したため、南部諸州には連邦から脱退する権利があると信じていた。
南部の脱退に関するブレッキンリッジの見解は当時物議を醸しており、現在でも議論が続いている。彼が米国に対する裏切り者だったと信じる人もいれば、南部の権利の擁護者だったと信じる人もいます。