ジョンソン大統領の計画に対するもう一つの反応は、暴力と脅迫を用いてアフリカ系アメリカ人を恐怖に陥れ、彼らの権利行使を妨げる白人至上主義団体、クー・クラックス・クラン(KKK)の台頭だった。 KKKは、投票したり、土地を所有したり、公職に就こうとしたアフリカ系アメリカ人を標的としたが、彼らの行動はしばしば地元の法執行機関からの抵抗をほとんど、あるいはまったく受けなかった。
さらに南部諸州は、アフリカ系アメリカ人の公民権と選挙権をそれぞれ保障する憲法修正第14条と第15条を無効にしようとした。これらの州は、修正案は違憲であり、各州の権利を侵害していると主張した。
要約すると、ジョンソン大統領の再建計画に対する南部の反応には、黒人法典の実施、クー・クラックス・クランの台頭、憲法修正第14条と第15条を無効にしようとする試みが含まれていた。これらの反応は、南北戦争とアフリカ系アメリカ人の解放によってもたらされた変化に対する抵抗の表れでした。