蛇に噛まれて悪臭を放つ傷 :フィロクテテスはトロイへ向かう途中、リムノス島に立ち寄りました。そこで彼は、神が遣わした水蛇と言われる毒蛇に噛まれてしまう。咬傷により重度の悪臭を放つ傷ができ、膿がにじみ出て、耐え難い悪臭が漂いました。その臭いと激しい痛みのため、ギリシャ指導者らは彼が遠征の負担になると判断し、彼を見捨てることを決めた。彼らは出航し、彼はわずかな物資だけを持ってリムノス島に残されました。
アテナの呪い :ピロクテテスは毒蛇に噛まれただけでなく、アテナの呪いを受けていました。この呪いは、女神アテナを表し、トロイの街を守ると信じられていた木像であるパラディウムの盗難に彼が関与したことによって引き起こされました。ギリシャ人はトロイへの旅の途中、クリュサのアテナ神殿に立ち寄ることにしました。アキレウスの息子ネオプトレモスは、オデュッセウスとディオメーデスによって像を回収するために派遣されました。残念なことに、パラディウムを捕獲するのに不可欠なヘラクレスの弓を扱うことができるのは、リムノス島に取り残されたフィロクテテスだけでした。アテナはこの盗難が冒涜であることを悟り、責任者への復讐を誓った。罰として、彼女はフィロクテテスに、彼を放棄する原因となった致命的な蛇咬傷を与えました。
ピロクテテスの放棄を取り巻く状況は、ギリシャ神話のさまざまな記述でわずかに異なることは言及する価値があります。いくつかのバージョンでは、この決定は、ヘラクレスの弓の助けによってのみトロイが占領されるであろうという神託によって与えられた予言の影響を受けました。
トロイア戦争中のピロクテテスの苦境と最終的にギリシャ軍に復帰することは、この戦争についての古典的なギリシャの物語の重要な部分となった。