イオニア戦争の概要
イオニア戦争は「デケレイア戦争」とも呼ばれ、ペロポネソス戦争の最終局面にあたる。二つの名称で呼ばれるのは、戦争が展開された主要な二つの戦線に由来する。
デケレイア
アテネの北方約21kmに位置する町。ここを拠点に、スパルタ王アギス2世（在位：紀元前427〜400/399年、エウリュポン朝、紀元前428年にアッティカへ侵攻したアルキダモス2世の子）率いるスパルタ軍が、アテネの都を絶えず攻撃し続けた。
イオニアのアナトリア沿岸
アテネからの離反や反乱が相次いだ地域である。
新たな戦争の性格
この新たな戦闘時期の性格と、交戦国にもたらされた結果は、シケリア（シチリア）遠征の大惨事による経済的（資源の喪失）・政治的な打撃に加わり、アテネにとってさらに不利な要因となった。
さらに、スパルタがアテネから奪われた指導権を引き継ぎ、ペルシアとの協調をいとわなかった点も見逃せない。ペルシアはスパルタの軍事行動に資金を提供し、イオニアの諸都市に反乱を煽った。この時期のペルシア側の主要人物は、ダレイオス2世（在位：紀元前424〜405年）と、サトラップ（総督）のティッサフェルネスおよびファルナバゾスである。また、アルキビアデスがギリシア政界に再登場したのもこの時期である。
アテネの政治危機：四百人政権（紀元前411年）
急進民主派の政治家に対する民衆の不満と、富裕層の疑念が政治危機を引き起こし、法的な手続きを経て民主政が廃止される事態に至った。既存の公職の停止や政治職能への報酬支給の停止に加え、四百人評議会が設置され、ブーレー（五百人評議会）に取って代わった。この評議会は全権を握り、5人の議長（プロエドロス）が置かれ、議長たちが評議会の残りのメンバーを選出する仕組みであった。
この不安定な状況は、サモス島に駐屯する艦隊の蜂起によってさらに悪化した。艦隊はこの政体変革を受け入れず、寡頭派を罷免し、アルキビアデスをストラテゴス（将軍）に選出した。この動きが最終的に四百人の寡頭政権の崩壊につながった。テラメネスの登場により、重装歩兵たちは権限を五千年人会議へ移譲することを決め、その最初の決定はアルキビアデスのアテネ帰還を布告することであった。
イオニア戦争の最終段階
ヘレスポントスでの攻防：アテネの連勝とスパルタの講和要請
紀元前411年から410年にかけて、アテネはヘレスポントス（ダーダネルス海峡）で三度の海戦に勝利した。キュノセマ、アビュドス、キュジコスである。トゥキュディデスの記述はキュノセマの海戦で終わり、クセノポンの『ヘレニカ（ギリシア史）』はキュジコスの勝利（紀元前410年3月）から始まるため、これらの戦いについては詳しく知られていない。
その後の数年間（紀元前409年〜408年）も、アテネに有利な展開が続いた。
トラシュロスはタソス島とトラキアのいくつかの拠点を回復した。アルキビアデスはビュザンティオンとカルケドンを征服した。彼は凱旋帰還を果たし、紀元前407〜406年にストラテゴスに再選され、ヘレスポントス方面の戦争指揮に関する特別な権限を与えられた。
ノティオン（エフェソス）海戦での敗北：意義と影響
紀元前407年末から406年初めにかけて、アルキビアデスの艦隊は副将アンティオコスの指揮下で、ノティオン（エフェソス）の海戦において敗北を喫した。
このアテネの敗北が意味したものは次の通りである。
- スパルタのナウアルコス（提督）リュサンドロスの登場。おそらくラケダイモン（スパルタ）の将軍の中で最も有能かつ大胆であり、イオニア戦争期における最も卓越したギリシアの戦略家の一人である。
- ペルシアのスパルタへの決定的な協力。ペルシアは財政支援に加え、ダレイオス2世の実子キュロスを派遣した。リュサンドロスとキュロスの良好な関係が、アテネの最終的な敗北を決定づけた。
- アルキビアデスの政治生命の終焉。ノティオンの敗北後、彼はギリシア政界から永久に去ることを余儀なくされた。
アルギヌーサイ海戦でのアテネの勝利（紀元前406年）
同じ紀元前406年、レスボス島沖、小アジア沿岸のアルギヌーサイ諸島で、アテネ最後の海戦での勝利がもたらされた。トラシュロスをはじめとするアテネの将軍たちは、カリクラティダス率いるスパルタ艦隊を撃破したのである。
しかし、アルギヌーサイの戦いの意義は、歴史家にとって軍事的な側面を超えて社会的・政治的な次元を持つものとなった。勝利した将軍たちが「嵐の危険がある」という理由で遭難者の救助を行わなかったとして告発され、有罪判決を受けたことが、アテネの民衆に大きな衝撃を与えたからである。
この一連の経緯は、急進民主政の致命的な欠陥を露呈させた。この裁判は、テラメネスによって仕組まれた、あるいは少なくとも主導されたものと考えられている。
アルギヌーサイ海戦における将軍たちへの弾劾の一件により、アテネは困難かつ決定的な時期に、最も優れた将軍たちと民主主義的理想の主要な擁護者たちを失うこととなった。