エジプトでは、クレオパトラが唯一の統治者となり、彼女の権力を確保し、カエサリオンの王位継承権を守るために一連の政治的工作を開始した。彼女はシーザーの最も忠実な将軍の一人であるマーク・アントニウスと同盟を結び、彼らは数年間東地中海を支配する強力な同盟を形成しました。
しかし、クレオパトラの野心とアントニーとの関係は、最終的に彼女の没落につながりました。紀元前 31 年、アントニウスとクレオパトラはアクティウムの戦いでオクタウィアヌス (後のアウグストゥス カエサル) に敗れました。戦いの後、クレオパトラはエジプトに逃げ、オクタヴィアンは彼女を追った。
クレオパトラは状況から抜け出す方法が見つからず、紀元前 30 年 8 月 12 日に自殺しました。彼女は毒蛇であるアスプを使って自ら命を絶ったと考えられている。彼女の死によりエジプトはローマ帝国の属州となり、プトレマイオス朝の時代は終わりを告げました。