アメリカ先住民の多くの部族は、自分たちの土地の大部分をアメリカ合衆国政府に譲渡する条約に署名することを強制された。これらの条約は不公平であることが多く、ネイティブアメリカンは土地に対して十分な補償を受けられないことが多かった。さらに、多くのアメリカ先住民は、遠隔地や望ましくない地域に位置することが多かった新しい居留地への移住を余儀なくされました。
戦争とその後の土地と資源の喪失は、ネイティブアメリカンのコミュニティに壊滅的な影響を与えました。多くのネイティブアメリカンが病気、飢餓、暴力により死亡しました。戦争はまた、伝統的な生活様式を破壊し、多くのネイティブアメリカンの文化がほぼ破壊されました。
南北戦争後の数年間、アメリカ政府はネイティブアメリカンを厳しく扱い続けました。政府は同化政策を確立し、ネイティブアメリカンに伝統文化を放棄させ、白人のアメリカ人のやり方を採用させることを目的としました。この政策はしばしば武力や強制を用いて実施され、ネイティブアメリカンのコミュニティにさらなる損害を与えました。
南北戦争とその余波は、ネイティブアメリカンにとって大きな苦しみの時代でした。土地の喪失、強制移住、伝統文化の破壊、米国政府による過酷な扱いはすべて、ネイティブアメリカンの人口と文化の衰退の一因となった。