イロコイ連合は、独立戦争当時、北東部で最も強力なネイティブ アメリカン同盟でした。イロコイ族は長い間イギリス軍の同盟国であり、以前の戦争でもイギリス軍とともに戦ったことがある。独立戦争が勃発したとき、イロコイ族は当初中立を保とうとしました。しかし、イギリスは土地やその他の報酬を約束することで、彼らに味方として戦争に参加するよう説得することができた。
チェロキー族は南東部最大のアメリカ先住民部族でした。彼らは当初アメリカ人に友好的でしたが、アメリカ人が彼らの土地に定住し始めてからは彼らに幻滅しました。 1776 年、チェロキー族はイギリスと同盟を結びました。しかし、アメリカ人は一連の戦いでチェロキー族を破ることに成功し、チェロキー族は土地の多くをアメリカ人に譲渡することを余儀なくされた。
他の多くのネイティブアメリカン部族は独立戦争中中立を保った。彼らは、白人の2つの強力なグループ間の紛争に巻き込まれたくありませんでした。彼らはまた、どちらかの側で戦うことが自国民の破壊につながる可能性があることを恐れていました。
独立戦争はネイティブアメリカンに大きな影響を与えました。その結果、土地が失われ、伝統的な生活様式が破壊され、アメリカ先住民の領土への白人の入植が増加しました。