アラゴン王国の新君主となったのは、アルフォンソ5世の弟にあたるフアン2世(在位1458年〜1479年)です。王位に就いた時点で、フアン2世はすでに豊富な政治経験を積んでいました。
カスティーリャでは「アラゴンの王子たち」と呼ばれる一派の指導的存在であり、ナバラでは最初の妻ブランカとの結婚により1425年から王配の座に就き、1441年以降は実質的な君主として統治を行いました。さらにアラゴン連合王国の内部でも要職を歴任しており、1415年から1416年にかけてはサルデーニャとシチリアの副王(代理総督)を務めています。
とはいえ、アラゴン王国、とりわけカタルーニャの情勢は、極めて危機的な状況にありました。

内戦の背景
フアン2世は長年にわたり、息子であるビアナ公カルロス(ナバラ王国の継承者)と対立関係にありました。この父子の確執はカタルーニャにも波及し、国王に批判的な諸勢力はビアナ公の支持へと傾いていきます。1460年のリェイダ議会はフアン2世と正面から衝突し、当時父王の捕虜となっていたカルロスの解放を実現させました。同時に、貴族や都市の名望家層(パトリシオ)から構成される「カタルーニャ公国評議会(Consell del Principat)」が組織されます。さらに翌1461年には、評議会はカルロス・デ・ビアナをカタルーニャの継承者と宣言するに至りました。
こうした動きを前に、フアン2世は交渉の道を選び、1461年6月にビラフランカ・デル・ペネデス協定に調印します。史家ホセプ・マリア・サルラッハによれば、この協定は儀礼王ペドロ4世の時代以来、寡頭支配層が掲げ続けてきた政治的要求をほぼすべて盛り込んだものであり、フアン2世の権威に重大な制約を課すものでした。その条項の一つに、アラゴン王がカタルーニャに入る際には、事前に公国評議会の許可を得なければならないというものがありました。
内戦の勃発

こうして、いわゆる協約主義(パクティスモ)の勢力──すなわち大領主、都市パトリシオ層、教会の一部指導者といった支配的社会集団──が勝利を収めたかに見えました。ところが、協定締結からわずか数ヶ月後にビアナ公カルロスが謎の死を遂げると、情勢は劇的に転換します。フアン2世と後妻フアナ・エンリケスの間の子フェルナンドが、アラゴン王位の継承者として宣誓されたのです。
一方のカタルーニャでは、まさに開戦前夜といえる緊迫感が漂っていました。1462年2月、ジローナ周辺のレメンサ農民(人格的束縛下に置かれた農奴的農民)が蜂起します。数日後にはバルセロナで大群衆となった職人たちが街頭に繰り出し、フアン2世への無条件の支持を訴えました。これに対抗して、公国評議会は急ぎ軍の編成に乗り出します。そして1462年3月11日、フアナ・エンリケスは息子フェルナンドを連れてバルセロナを離脱したのです。
ここから、およそ10年間に及ぶ過酷な内戦が始まりました。フアン2世陣営には、フランスからの軍事支援に加えて、レメンサ農民や都市の民衆層の支持がありました。対するのは主に農村と都市の寡頭支配層で、その意思はジェネラリタット(Diputació del General)によって体現されましたが、民衆の一部も反乱側に加わっています。反乱側は当初、カスティーリャ王エンリケ4世(1462年)を公国の君主に据えることを画策し、その辞退後はポルトガルのペドロ(コンスタブル)(1464年〜1466年)、最後にはアンジューのルネ(1466年〜1472年)と、盟主候補を次々と替えていきました。しかし戦局は、徐々に王党派に傾いていきます。
内戦の主な経過
この紛争の主な転換点をたどってみましょう。1462年、反乱軍に包囲されたジローナは耐え抜くことに成功します。1464年にはリェイダが王党派の手に落ちました。1465年、フアン2世の軍はカラフの戦いで敵を打ち破り、その後数ヶ月のうちにセルベーラやトルトサをはじめとする諸都市を占領していきます。確かに1467年には反乱側がビラデムルスで勝利し、アンプルダーン地方を支配下に置きました。しかし王党派は反撃に転じ、1471年の終わりにはジローナ奪還やサンタ・コロマ・デ・グラマネートでの勝利など、新たな戦果を重ねていきます。
そして1472年10月、長期にわたる包囲戦の末にバルセロナがフアン2世の手に落ち、カタルーニャ内戦はここに終結しました。反乱側の降伏はペドラルベス協定として結実します。フアン2世は融和路線を採り、報復措置や粛清は一切行われませんでした。ただし、フランス王政との関係は難しくなります。1462年に軍事援助の見返りとしてフアン2世がフランス王に譲り渡したルシヨンとセルダーニャの両地域を、フランス側は和平成立後も返還しようとしなかったためです。1479年初頭、フアン2世は80歳の高齢でその生涯を閉じました。