1949年1月31日、ギリシャ共産党（KKE）の悪名高い第5回中央委員会総会は、「マルコス・ヴァフィアディスは数か月にわたり重篤な病を患っており、党中央委員会から与えられた重大な任務に応えることができない」との理由で、彼を「あらゆる党活動から」解放することを決定した。
こうしてマルコスは、臨時「民主」政府の「首相」、政治局員、そしてギリシャ民主軍（DSE）最高司令官という三つの要職をすべて失ったのである。
突然の解任ではなかった
マルコスの解任は、突如降って湧いたものではない。ザカリアディスとの決裂、そして彼の「首切り」は、複雑かつ長期にわたる過程の産物だった。その発端は早くも1947年9月、第3回中央委員会総会にさかのぼる。当時マルコスは、ザカリアディスの無謀にして大仰な計画（いわゆる「レイクス計画」）に対してすでに反発していたのだ。
マルコスは、DSEはあくまでゲリラ部隊として戦い続けるべきだと主張し、「偉大なるソ連祖国」や「社会主義」諸国からの外部支援なしに勝利することは不可能だと確信していた。1947年11月には政治局会議の席上、コニッツァ攻撃をめざすザカリアディスの計画にも異議を唱えている。
故ザカリアディスよりも明らかに経験豊富で、反乱軍の弱点を熟知していたマルコスは、メトソヴォでの同種作戦が失敗に終わっていたこともあり、この作戦に強い留保を示した。
しかし結局マルコスは折れ、攻撃は強行され、DSEは壊滅的な敗北を喫した。敗北を受け、1948年1月15日にはプレスペス湖畔で情勢評価のための会合が開かれた。ここで新たな論争が勃発する。ザカリアディスがDSEを正規軍へと改編し、「スターリン主義の戦略と戦術」を実践させようとしたのである。……そもそもスターリンがどれほどの戦略家・戦術家であったのかについては、今日でも大きな議論が続いているところだ。
マルコスは、指導者の「不可謬性」に公然と異を唱えた――「民主」政党においては重大な過ちである。彼は、DSEが有する幹部層のままでは正規戦で勝利できる見込みはないと強調した。この公然たる対立こそが、最終的な決裂の引き金となった。さらに1948年8月18日、グラモスの敗北後、チトーとの対立をめぐって両者は再び衝突する。マルコスは、チトーの転向後、DSEに残された唯一の選択肢はゲリラ戦であることを改めて力説した。
栄光はザカリアディスに、スケープゴートはマルコスに
当然ながら、ザカリアディスの意見が通った。軍の失敗にもかかわらず、DSEが一時的な成功を収めたことでザカリアディスの威信はむしろ高まり、逆にマルコスは厄介者扱いされるようになった。
1948年8月21日のDSE戦争評議会では、マルコス解任問題が正式に取り上げられた。とはいえ、ザカリアディスもすぐさま解任に踏み切る勇気は持たなかった。ただし、マルコスが率いる臨時「民主」政府と総司令部（GA）の権限は大幅に制限された。
同日、マルコスは「休養」のためアルバニアへ送られ、総司令部では中将に昇進したグシオスが後を継いだ。事態が決定的にエスカレートしたのは、1948年11月15日、KKE政治局会議においてマルコスが悪名高い「プラットフォーム（意見書）」を提出したときである。
「プラットフォーム」――最後の政治的抵抗
この文書の中でマルコスは、1946年以来のザカリアディスの指導を公然と批判した。5万〜7万人の戦闘員動員計画を痛烈に非難し、コニッツァ作戦の失敗と政府樹立の宣言、DSEの正規軍化、グラモス作戦、そしてそれらの結果に基づく1949年の戦争継続決定といった一連の過ちを改めて浮き彫りにしたのである。
「プラットフォーム」の中でマルコスはこう明言している。「王制ファシスト軍は、DSEに決定的な打撃を与えられていないにもかかわらず、2年間、途絶えることなく戦い続けている。DSEへの離反も脱走もほとんど見られない……この軍は損耗を補充する能力を持つだけでなく、通常の数的増強さえ遂げている…」
「現在、DSEの戦闘員は約2万5,000名にすぎない。対する王制ファシズム側の総兵力は30万に達する。1948年10月〜12月、1949年1月〜3月にかけて、王制ファシズムの完全な打倒を支える重要地域の解放に向けた攻勢を展開するには、DSEは6万5,000〜7万人に達していなければならなかった……だが最良の条件下ですら、我々が1年間に動員できたのはわずか1万5,000人ほどだった。」
マルコスの「プラットフォーム」は党によって「反党的」「分派主義的」「トロツキスト的」と断罪され、これが彼の最後の政治的行動となった。しかしながら、マルコスが「斬首」された事実は直ちには知らされなかった。それまでザカリアディスと党は、マルコスを伝説的英雄として祭り上げていたからである。DSEの隊員たちが、健康上の理由によるマルコス解任を知らされたのは、ようやく1949年1月31日のことであった。
亡命と転落――そして最後の言葉
マルコスは事実上ソ連での亡命生活にあったため、DSEの崩壊を間近で目にすることはなかった。1950年にKKEから除名され、1956年に復党するものの、1961年には永久に除名された。彼は終生、ザカリアディスを「スパイ（エージェント）」と非難し続けた。その後の人生を彼はソ連で「イワン・ワシリエヴィチ・クーリエフ」の偽名のもとに送った。現地で働き、ロシア人女性と結婚し、一人息子をもうけている。1983年にギリシャへ帰国し、全ギリシャ社会主義運動（PASOK）から国会議員に選出された。
「ギリシャの土が、生涯を通じて陰謀ばかり企ててきた多重スパイ、ならず者を覆うことになるのは遺憾だ。彼はソビエト連邦と人民運動に対して並々ならぬ憎悪を抱いており、その証拠はいくらでもある。いずれにせよ、彼が内戦において成し遂げようとしたことは、結局のところ実現してしまったのだ」――これが、ザカリアディスについて語られたマルコス最後の言葉であった。