職員問題
インド分割に伴う宗教対立（コミュナリズム問題）のため、ジョードプル鉄道の一部職員は、家族を連れてパキスタンから脱出することが極めて困難な状況に置かれていました。シンド州で勤務していたヒンドゥー教徒の職員600名は、出国の難航により数日間にわたって勤務に就けなくなりました。しかし、ようやくインドへ戻った彼らを待っていたのは、鉄道当局による再雇用の拒否でした。3か月間の停職処分の末、ついに解雇が決定されたのです。
これに対し、ジョードプルの鉄道職員たちは1947年11月28日、首相宛てに覚書を提出しました。この覚書は首相官邸から鉄道省へ回付されましたが、鉄道省は「この件については何もできない」と州省（藩王国担当部門）へ通知するだけでした。というのも、藩王国省はすでに鉄道省に対し、ジャイプル、ジョードプル、ビーカーネール、ウダイプルの各藩王国とは直接文書のやり取りを行わないよう、明確な指示を出していたからです。
同様に、ジョードプル職員組合も州省に覚書を提出し、以下のような要求を掲げました。
- 職員組合の政府による公認
- 給与委員会報告に基づく給与・手当の引き上げ
- 物価手当（デアネス・アローワンス）の増額
- 労働者向けの図書館およびクラブ施設の設置
- 労働者とその家族のための無料病院の設置
この件は藩王国省から、ラージプーターナー地方の弁務官（本部はアブー）へと送られ、対応が検討されることとなりました。
ジョードプル鉄道資産の保全
独立以前、シンド地方はイギリス領インドのボンベイ管区に属していました。1900年、ジョードプル鉄道は西部国境沿いのバロートラからイギリス領との境界まで、全長133.40マイルの鉄道路線を敷設しました。続いて1929年1月1日、インド政府はシンド軽便鉄道会社（Sindh Light Railway Company Limited）からミールプル・ハース関連区間を買収し、その運営管理をジョードプル鉄道に委ねました。さらに1939年には、カドルーからナワーブシャーまで全長30.72マイルの路線がジョードプル鉄道によって敷設され、同年11月29日に開業しています。
そして1942年12月31日、インド政府はシンド軽便鉄道からミールプル・ハース〜カドルー間49.50マイルの路線も買収し、ジョードプル鉄道へ移管しました。これにより、ジョードプル鉄道が運営するイギリス領内区間の総延長は318.74マイルに達しました。この路線の運行はすべてジョードプル鉄道が担っており、車両（ローリングストック）もすべて同鉄道の所有物でした。
シンド地方がパキスタンに帰属する兆しが見え始めると、当時のジョードプル鉄道技師長C.L.クマールは、卓越した手腕と機転をもって、シンド地域内の各駅倉庫に保管されていた鉄道資材や、現地の建設監督官・軌道監督官事務所の備品などをジョードプルへ移送する作業を迅速に進めました。この適切な判断がなければ、数百万ルピー相当の鉄道資材がパキスタン領内に取り残されるところでした。
一方、車両の引き渡し日は1947年7月31日と定められていましたが、その数日前、パキスタン政府は機関車6両、客車75両、要人専用車4両、貨車300両以上を強制的に差し押さえてしまいました。その価値は約170万ルピーと見積もられ、これによりジョードプルとパキスタン間を結ぶ列車運行は完全に停止してしまいました。
ジョードプル藩王国政府はパキスタン政府に対し、差し押さえられた車両の返還と、パキスタン側に残された収益500万ルピーの支払いを求め、交渉のための代表派遣も要請しました。しかし、パキスタン政府はこれに一切応じませんでした。そこでジョードプル藩王国の宰相ジャイ・ナライン・ヴィヤースは、駐パキスタン・インド高等弁務官プラカッシュ氏と協議を行いました。最終的にはジャワーハルラール・ネルーの介入により、パキスタン政府はジョードプル政府へ500万ルピーを支払うことで決着したのです。