1940年、インド共産党（CPI）は、イギリスとの闘争に消極的であるとしてガンディーの指導を厳しく批判しました。ところが、1941年にナチス・ドイツがソ連へ侵攻すると、情勢は一変します。モスクワは世界のすべての共産主義勢力および進歩的勢力に対し、ソ連、あるいはソ連と同盟する連合国側の戦いに貢献するよう呼びかけたのです。
ムスリム連盟支持への転換
当時のCPI書記長P・C・ジョーシーは、ムスリム連盟こそがインド亜大陸における支配的な政治組織であるという見解を示し、国民会議派に対して分離独立国家の要求を受け入れるよう促しました。
1942年9月、CPI中央委員会はこの提案を正式に採択します。その内容は、「同盟的な領土、共通の歴史的伝統、共通の言語・文化・心理的傾向、そして共通の経済生活を持つインドの各民族集団は、それぞれ独立した民族（ナショナリティ）として認められるべきであり、連邦内において自治州としての地位を与えられるとともに、連邦から自由に分離する権利をも有すべきである」というものでした。これは事実上、パキスタン建國運動への理論的支持を意味するものでした。
ケララでの「パキスタン万歳」デモ
1940年代半ばには、E・M・S・ナンブーディリパッドやA・K・ゴーパランらケララ州の共産党指導者が、「パキスタン・ジンダーバード（パキスタン万歳）」「モーパリスタン・ジンダーバード」というスローガンを掲げてムスリムのデモ行進を率いました。
このため、左派の知識人だったクワジャ・アフマド・アッバースは、「インド共産党は、ムスリム分離主義者たちに原理的な根拠を与えるなど、インドに深刻な損害をもたらした」と述べざるを得なかったのです。
1946年の路線転換――しかし時すでに遅し
しかし1946年になると、イギリス共産党の有力理論家ラジニ・パルメ・ダットからの圧力を受け、CPIは突如として立場を転換します。パキスタンの創設を「イギリス帝国主義とムスリム資本主義の間の陰謀」であると非難するようになったのです。
しかしその時点ですでに手遅れでした。ムスリム系共産主義者たちがその態度を改めることはできず、党の二転三転する方針はその後の信頼性にも影を落とすこととなりました。