しかし、カトリック教徒の避難所としてのメリーランド州の成功には課題がなかったわけではありません。この植民地は近隣植民地のプロテスタント入植者の反対に直面し、またカトリック教徒の異なる派閥間の内部抗争にも悩まされていた。これらの課題にもかかわらず、メリーランド州は初期の歴史の大部分においてカトリック教徒が多数を占める植民地であり続けました。
18世紀になると、イギリスやドイツなどのプロテスタント諸国からの移民の影響で、メリーランド州のカトリック人口は減少し始めた。 18世紀の終わりまでに、メリーランド州ではプロテスタントの数がカトリックの数を上回りました。しかし、メリーランド州は寛容な植民地であり続け、多くのカトリック教徒の故郷であり続けました。
結論として、メリーランド州は、迫害されている英国のカトリック教徒の避難所となるという当初の目的を達成することにほぼ成功した。この植民地の宗教に対する寛容さと、新世界でのカトリック教徒にとっての安全な避難所としての立地が、多くの入植者をこの植民地に引き付けるのに役立った。しかし、メリーランド州はプロテスタント入植者からの挑戦や国内紛争に直面し、18世紀にはカトリック人口が減少した。これらの課題にもかかわらず、メリーランド州は寛容な植民地であり続け、多数のカトリック教徒の本拠地であり続けました。