病気: ヨーロッパの探検家たちは旅行中にしばしば未知の病気に遭遇し、その結果乗組員の死亡率が高くなりました。アメリカ大陸では、黄熱病、天然痘、マラリア、さまざまな呼吸器疾患などの病気が、自然免疫を持たずに新しく到着したヨーロッパ人にとってしばしば致命的でした。逆に、ヨーロッパ人によってもたらされたインフルエンザ、麻疹、発疹チフスのような病気は、先住民の人口を激減させました。
極端な気象条件: さまざまな地域で遭遇した極端な気象条件は、探査に大きな課題をもたらしました。北極周辺の極寒の海、アフリカの灼熱の砂漠、または南米の高温多湿なジャングルを航行するには、探検家は迅速に適応し、極度の寒さ、暑さ、高レベルの湿度などの過酷な環境に耐える必要がありました。
敵対的な先住民族: 一部の先住民族はヨーロッパの探検家を好奇心と寛容さをもって歓迎しましたが、他の先住民族は新参者に対して警戒したり、防御的でさえありました。探検家たちは武力抵抗、資源をめぐる紛争、文化の違い、誤解などに直面し、友好関係を築き領土を探索する試みが妨げられました。
地理的障壁: 険しい地形、鬱蒼としたジャングル、そびえ立つ山々、広大な砂漠、そして恐るべき水路は、探検にとって物理的な障壁となっていました。探検家は、これらの課題を克服するために、船を移動させたり、橋を建設したり、鬱蒼とした植生に道を掘ったりするなど、創造的な戦略を考案する必要がしばしばありました。
限られた供給品と食料品: 数か月にわたる航海では、物資や食料、特に傷みやすい食料や淡水の効率的な管理が必要でした。長期にわたる遠征における適切な栄養の欠如と不十分な医療は、探検家とその乗組員に栄養失調、壊血病などの病気、全身疲労を引き起こしました。
政治的および文化的な衝突: ヨーロッパの探検家は、独特の政治構造や文化規範を持つ文明に頻繁に遭遇しました。場合によっては、これらの違いが誤解、対立、あるいはあからさまな敵意を引き起こし、安定した外交関係を確立したり、特定の地域をさらに探索したりすることが困難になることがありました。